1. Prenos génov na divokých príbuzných:Medzi plodinami GM a ich divokými príbuznými sa môže vyskytnúť tok génov prostredníctvom krížového opelenia. Tento prenos modifikovaných génov do divokých populácií môže potenciálne narušiť prírodné ekosystémy, pretože zavedené gény by mohli prepožičať nové, zmenené znaky v divokých rastlinách, ktoré by mohli ovplyvniť ich prežitie a reprodukčný úspech.
2. Zmeny v spoločenstvách rastlín:Zavedenie plodín GM so zvýšenými vlastnosťami, ako je napríklad rezistencia na herbicídny, môže mať za následok zmeny v spoločenstvách rastlín. Druhy buriny, ktoré sú odolné voči herbicídu používaným s plodinami GM, sa môžu stať častejším, čím sa mení konkurenčná rovnováha medzi rôznymi druhmi rastlín. Tento posun v spoločenstvách rastlín by mohol negatívne ovplyvniť biodiverzitu pôvodných rastlín.
3. Vplyv na necieľové organizmy:Niektoré plodiny GM môžu exprimovať proteíny, ktoré sú toxické alebo škodlivé pre necieľové organizmy, ako je hmyz a iné voľne žijúce zvieratá. Rozsiahle využívanie plodín GM by mohlo potenciálne znížiť biodiverzitu ovplyvňovaním prospešného hmyzu, vtákov a iných zvierat, ktoré hrajú rozhodujúcu úlohu v ekosystéme.
4. Strata genetickej diverzity:Monokultúrne poľnohospodárske postupy často spojené s pestovaním plodín GM môžu viesť k zníženiu genetickej diverzity v rámci druhov plodín. Keďže poľnohospodári sa stále viac spoliehajú na malý počet odrôd GM s vysokým výnosom, genetická základňa plodín sa stáva užšou, čo by ich mohlo zvýšiť zraniteľných škodcov, chorôb a zmeny životného prostredia.
5. Vývoj rezistentných škodcov:Kontinuálne používanie GM plodín, ktoré vyjadrujú špecifické znaky odolné voči škodcom, môže vyvíjať selekčný tlak na populácie škodcov. V priebehu času môžu škodcovia vyvinúť odolnosť voči zavedeným vlastnostiam, ktoré si vyžadujú rozvoj nových odrôd GM alebo alternatívnych stratégií riadenia škodcov, čo potenciálne vedie k cyklu vývoja odporu.
6. Vplyv na pôdne organizmy:Aplikácia herbicídov používaných s plodinami rezistentnými na Herbicídny GM môže mať negatívne účinky na mikroorganizmy pôdy. Niektoré herbicídy môžu narušiť mikrobiálne spoločenstvá v pôde a ovplyvňujú cyklistiku živín, procesy rozkladu a celkové zdravie pôdy, ktoré môžu ovplyvniť väčší ekosystém.
Celkovo sú potenciálne účinky geneticky modifikovaných plodín na biodiverzitu zložité a vyžadujú starostlivé hodnotenie a riadenie. Zatiaľ čo plodiny GM majú potenciál priniesť poľnohospodárske výhody, je dôležité vykonávať dôkladný výskum a vykonávať vhodné opatrenia na monitorovanie a zmiernenie rizika s cieľom minimalizovať akékoľvek negatívne vplyvy na biodiverzitu a širší ekosystém.