Existujú však dva poddruhy:
* Hippopotamus Amphibius Amphibius: Toto je nominované poddruhy a nachádza sa vo väčšine hrochov v subsaharskej Afrike.
* hippopotamus amfibius kiboko: Tieto poddruhy sa nachádzajú na západe od druhu, predovšetkým v západnej Afrike.
Je dôležité poznamenať, že tieto dva poddruhy sú veľmi podobné a rozdiely medzi nimi sú jemné. Niektorí tvrdia, že vôbec nie sú odlišnými poddruhmi, ale skôr populáciou v rámci jedného druhu.
K dispozícii je tiež pygmy hippopotamus (choeropsis liberiensis) , čo je samostatný druh úplne a oveľa menší ako bežný hroch. Nachádzajú sa v lesoch Libérie a Sierra Leone.
Takže, zatiaľ čo existujú rôzne populácie a poddruhy hrochov, existuje iba jeden skutočný druh hippopotamu: hippopotamus amphibius.