Mäkkýše je široký pojem, ktorý sa týka akéhokoľvek typu vodných bezstavovcov, ktorý má škrupinu, ako sú mušle, ustrice, mušle a hrebenatky. Kôpory sú typom článkonožcov, ktoré majú segmentované telesné a spojené prívesky, ako sú krevety, kraby a homáre. Bivalvy sú typom mäkkýšov, ktoré majú dve sklonené škrupiny, ako sú mušle, ustrice a mušle.
Takže nie všetky mäkkýše sú kôrovce a nie všetky mäkkýše sú lastúrniky. Existuje mnoho rôznych typov mäkkýšov a možno ich klasifikovať do rôznych skupín na základe ich fyzických charakteristík a vývojových vzťahov.