Oficiálnou príčinou smrti bola pneumonia , ktorý bol pravdepodobne vyvolaný kombináciou faktorov:
* kompromitovaný imunitný systém: Keiko mal v anamnéze zdravotné problémy, vrátane parazitov a bakteriálnych infekcií, pravdepodobne kvôli jeho rokom v zajatí a stresu života v kontrolovanom prostredí.
* Vystavenie studenej vode: Zatiaľ čo v neskorších rokoch žil v prírodnom zátoke na Islande, Keiko stále zažil teplotu studenej vody, čo mohlo oslabiť jeho imunitný systém.
* Podkladové podmienky: Zatiaľ čo pneumónia bola bezprostrednou príčinou smrti, základné zdravotné problémy mohli prispieť k jeho oslabeniu štátu a zraniteľnosti.
Je dôležité poznamenať, že Keiko smrť vyvolala debatu o etike udržiavania orkov v zajatí. Zatiaľ čo jeho príbeh priniesol povedomie o situácii v zajatí Orcas, rozhodnutie ho vrátiť do voľnej prírody bolo zložité a nakoniec neúspešné.