Endospóry vďaka svojmu jedinečnému zloženiu vydržia vysoké teploty. Vonkajšia vrstva endospory, známa ako exosporium, poskytuje ochranu pred drsnými podmienkami. Jadro endospóry obsahuje dehydrovanú bunku a vysokú koncentráciu kyseliny dipikolínovej, ktorá prispieva k jej tepelnej odolnosti.
Zatiaľ čo vriaca voda môže zabiť väčšinu vegetatívnych baktérií (aktívne rastúca a deliaca sa forma baktérií) pri 100 stupňoch Celzia, nemusí to stačiť na zabitie endospór. Tieto spóry môžu prežiť teploty varu po dlhšiu dobu, od niekoľkých minút do niekoľkých hodín. V niektorých prípadoch môžu endospóry dokonca prežiť roky vo vriacej vode.
Na účinné ničenie endospór sú potrebné vyššie teploty a/alebo dlhšie expozičné časy. Na zabezpečenie deštrukcie endospór sa bežne používa para pod tlakom v autokláve, ktorý dosahuje teploty nad 121 stupňov Celzia (250 stupňov Fahrenheita) a tlakovanie na zvýšenie prieniku pary. Táto sterilizačná metóda je nevyhnutná v rôznych priemyselných odvetviach vrátane potravinárskeho, farmaceutického a medicínskeho prostredia.
Je dôležité poznamenať, že prevarenie vody pri 100 stupňoch Celzia je stále zásadným krokom pri príprave jedla a sanitácii, pretože môže zabiť mnoho škodlivých baktérií a vegetatívnych buniek. Nemalo by sa však spoliehať výlučne na elimináciu endospór, najmä v prípadoch, keď je potrebná úplná sterilizácia. Na zabezpečenie zničenia týchto pružných štruktúr môžu byť potrebné ďalšie opatrenia, ako je tlakové varenie alebo autoklávovanie.