Tučniaky galapágske sú endemické na Galapágskych ostrovoch, vďaka čomu sú geograficky izolované od iných druhov tučniakov a ich prežitie je závislé od jedinečného ekosystému súostrovia. Ich populácia je relatívne malá, odhadom zostáva 1 200 až 2 000 jedincov. Táto obmedzená veľkosť populácie ich robí náchylnejšími na rôzne hrozby a zmeny životného prostredia.
2. Strata a degradácia biotopov
Galapágy sú obľúbenou ekoturistickou destináciou a zvyšujúca sa prítomnosť ľudí viedla k strate a degradácii biotopov. Výstavba turistických zariadení, zavádzanie inváznych druhov, zvýšené znečistenie a vyrušovanie ľudskou činnosťou negatívne ovplyvnili hniezdiská a kŕmne miesta tučniakov.
3. Zmena klímy
Galapágy sú veľmi citlivé na zmenu klímy, zažívajú stúpajúcu hladinu morí, zmeny oceánskych prúdov a zvýšenú frekvenciu a intenzitu extrémnych poveternostných udalostí. Tieto zmeny narúšajú krehkú rovnováhu morského ekosystému a ovplyvňujú dostupnosť potravinových zdrojov, ako sú ryby a krill, od ktorých sú tučniaky závislé. Otepľujúce sa teploty oceánov môžu tiež priamo stresovať tučniaky a ovplyvniť ich reprodukčný úspech.
4. Nadmerný rybolov a konkurencia
Nadmerný rybolov malých pelagických rýb, ktoré sú primárnou korisťou tučniakov z Galapág, znižuje dostupnosť potravy. Okrem toho súťaž o zdroje potravy s inými morskými predátormi, ako sú uškatce a väčšie druhy rýb, môže ďalej obmedziť prístup tučniakov k obžive.
5. Choroba a parazity
Tučniaky z Galapág sú náchylné na rôzne choroby a parazity, vrátane vtáčej kiahne, vtáčej malárie a črevných parazitov. Tieto choroby sa môžu v populácii tučniakov rýchlo šíriť, čo spôsobuje vysokú úmrtnosť, najmä medzi kurčatami a mláďatami.
6. Predácia
Zavlečenie nepôvodných predátorov, ako sú mačky, potkany a psy, na Galapágy predstavuje pre tučniaky významnú hrozbu. Títo predátori sa živia tučniačími vajíčkami, kurčatami a dokonca aj dospelými tučniakmi, čo prispieva k poklesu ich populácie.