Mississippi je domovom rôznych biomov vrátane:
- mierne listnaté lesy :Tieto lesy sa nachádzajú v severných a východných častiach štátu a vyznačujú sa stromami, ktoré v zime strácajú listy. Medzi najbežnejšie stromy v týchto lesoch patria dub, Hickory, Maple a Walnut.
- borovicové lesy :Tieto lesy sa nachádzajú v južných a západných častiach štátu a vyznačujú sa stromami, ktoré majú ihlové listy. Medzi najbežnejšie stromy v týchto lesoch patrí borovica s dlhou borovicou, borovicu s lomkou a borovicu.
- mokrade :Tieto oblasti sa vyznačujú stojacou vodou alebo zaklápacou pôdou a možno ich nájsť v celom štáte. Medzi najbežnejšie mokrade v Mississippi patria močiare, močiare a rašeliniská.
- trávne porasty :Tieto oblasti sa vyznačujú trávami a inými bylinnými rastlinami a nachádzajú sa v severných a západných častiach štátu. Medzi najbežnejšie trávne porasty v Mississippi patria prérie a savany.
- pobrežná planina :Tento biom sa nachádza pozdĺž Mexického zálivu a vyznačuje sa nízko položenou pôdou a piesočnatou pôdou. Medzi najbežnejšie rastliny v tomto biome patrí morské ovos, dunové trávy a palmetto stromy.