Trilobity: Tieto vyhynuté morské článkonožce sú široko rozšírené v Pyrenejach. Darilo sa im v paleozoickej ére, od kambria až po devón. Fosílie trilobitov možno nájsť na mnohých miestach, napríklad v kambrických bridliciach neďaleko Gavarnie vo Francúzsku a v ordovických vápencoch v oblasti Vallibierna v Španielsku.
Amonity: Amonity sú vyhynuté hlavonožce, príbuzné súčasným kalamárom a sépiám. Bežne sa vyskytujú v druhohorných horninách Pyrenejí, najmä v období jury a kriedy. Fosilizované amonity možno pozorovať vo vápencoch a slieňoch lokalít ako Col de Ares vo Francúzsku a Sierra del Montsec v Španielsku.
Echinoidy (morské ježovky): Echinoidy sú morské bezstavovce s ostnatými schránkami. Ich fosílie sú rozšírené v Pyrenejach, od paleozoika až po treťohorné obdobia. Možno ich nájsť v plytkých morských ložiskách, ako sú kriedové vápence v oblasti Roncal v Španielsku.
Rudistické lastúrniky: V období neskorej kriedy boli rudistické lastúrniky hojné. Sú veľké a často bizarného tvaru a v niektorých oblastiach Pyrenejí tvoria útesové štruktúry. Skamenelé rudisti možno pozorovať na miestach, ako je roklina Gavarnie a oblasť Luz-Saint-Sauveur vo Francúzsku, ako aj v Národnom parku Ordesa a Monte Perdido v Španielsku.
Nummulity: Nummulity sú vyhynuté jednobunkové foraminifery, ktoré žili v teplých, plytkých moriach. Fosílie numulitov sú bežné v eocénnych vápencoch v oblasti Pyrenejí, najmä v oblasti Hecho v Španielsku a oblasti okolo Pau a Mauléonu vo Francúzsku.
Oligocénne cicavce: Pyreneje tiež poskytli dôležité fosílie cicavcov z epochy oligocénu, ako sú pozostatky skorých primátov, hlodavcov a mäsožravcov, čo poskytuje pohľad na skorý vývoj týchto skupín.
Toto je len niekoľko príkladov rôznych fosílií nájdených v Pyrenejach. Zložitá geologická história a environmentálne podmienky pohoria viedli k bohatému a dôležitému paleontologickému dedičstvu, ktoré naďalej priťahuje vedcov a výskumníkov z celého sveta.