Hlavnou príčinou ohrozenia nosorožca indického je strata biotopu a fragmentácia. Prirodzený biotop tohto druhu, vysoké trávne porasty a lesy v regióne Terai, boli značne premenené na poľnohospodárstvo, ľudské osídlenie a rozvoj infraštruktúry. To viedlo k výraznému zníženiu dostupného biotopu a jeho fragmentácii, čo izolovalo populácie a narušilo ich prirodzené migračné vzorce.
Pytliactvo
Nosorožce indické sú zamerané pre svoje rohy, ktoré sú vysoko cenené v tradičnej ázijskej medicíne a využívajú sa pri nelegálnom obchode s divou zverou. Mylne sa predpokladá, že roh nosorožca má liečivé vlastnosti, napriek tomu, že vedecké dôkazy tieto tvrdenia vyvracajú. Nezákonný dopyt po rohoch nosorožcov podporuje pytliactvo, ktoré vedie k smrti týchto majestátnych zvierat.
Inbreeding
V dôsledku zníženej veľkosti populácie a fragmentácie zaznamenal nosorožec indický príbuzenskú plemenitbu. Príbuzenské kríženie môže viesť ku genetickým poruchám, zníženiu reprodukčného úspechu a zníženiu celkovej kondície, čo ďalej ohrozuje prežitie druhu.
Historické faktory
Druhy tiež trpeli historickými faktormi, ako je nadmerný lov a degradácia biotopov počas koloniálneho obdobia a začiatkom 20. storočia, kým sa nezaviedli ochranné opatrenia.
Riešenie týchto výziev si vyžaduje spoločné úsilie vlád, ochranárskych organizácií a miestnych komunít na ochranu a obnovu vhodných biotopov, boj proti pytliactvu a nelegálnemu obchodu s voľne žijúcimi druhmi, implementáciu účinných politík ochrany a podporu povedomia a vzdelávania o dôležitosti ochrany voľne žijúcich živočíchov a rastlín.