Poľovníctvo: Jaguáre sú tiež lovené pre kožušinu a iné časti tela. Ich zuby a pazúry sa často predávajú ako suveníry a ich mäso sa niekedy konzumuje. V niektorých oblastiach sa jaguáre lovia aj pre šport.
Konflikt s ľuďmi: Jaguáre sa niekedy môžu dostať do konfliktu s ľuďmi, najmä keď lovia dobytok. To môže viesť k tomu, že farmári a farmári zabíjajú jaguáre ako odvetu.
Zmena klímy: Klimatické zmeny majú negatívny vplyv aj na jaguáre. Ako sa klíma otepľuje, biotopy jaguárov sú čoraz teplejšie a suchšie, čo im sťažuje prežitie.
V dôsledku týchto hrozieb sú jaguáre teraz Medzinárodnou úniou na ochranu prírody (IUCN) klasifikované ako „takmer ohrozené“. To znamená, že ak sa nezintenzívni úsilie o ich ochranu, v blízkej budúcnosti im hrozí vyhynutie.