Nie, aligátor nie je ohrozený druh. Aligátor americký (Alligator mississippiensis) je podľa Medzinárodnej únie na ochranu prírody (IUCN) zaradený medzi „najmenšie obavy“. Aj keď boli kedysi považované za ohrozené v dôsledku nadmerného lovu a straty biotopov, snahy o ich ochranu viedli k výraznému oživeniu populácie.