Tu je niekoľko konkrétnych príkladov rôznych prostredí, kde možno nájsť prokaryoty:
Pôda :Prokaryoty sú bohaté na pôdu, kde zohrávajú kľúčovú úlohu pri kolobehu živín a rozklade organickej hmoty.
Voda :Prokaryoty sa nachádzajú vo všetkých typoch vodných útvarov vrátane oceánov, jazier, riek a rybníkov. Sú obzvlášť hojné v slnkom ožiarených povrchových vrstvách vody, kde vykonávajú fotosyntézu.
Vzduch :Prokaryoty, vrátane baktérií a archaea, sú prítomné vo vzduchu, najmä v prachových časticiach. Niektoré prokaryoty môžu dokonca prežiť v extrémnych podmienkach hornej atmosféry.
Extrémne prostredia :Prokaryoty sú pozoruhodne prispôsobivé organizmy, ktoré dokážu tolerovať extrémne podmienky. Napríklad niektoré prokaryoty dokážu prežiť vo vriacich vodách horúcich prameňov, zatiaľ čo iným sa darí v mrazivých teplotách polárneho ľadu.
Vo vnútri iných organizmov :Prokaryoty môžu tiež žiť v úzkom spojení s inými organizmami. Napríklad mnohé prokaryoty sa nachádzajú ako symbionty v telách zvierat, rastlín a iných mikroorganizmov.
Celkovo rozmanitosť prostredí, v ktorých sa prokaryoty nachádzajú, odráža ich obrovskú adaptabilitu a ekologický význam. Sú to skutočne všadeprítomné organizmy, ktoré zohrávajú zásadnú úlohu vo fungovaní všetkých ekosystémov.