koordinácia motora: Nervový systém riadi pohyb a koordináciu tela a príveskov morského koníka. Pomáha im upravovať ich umiestnenie a lokomóciu vo vode.
Behaviorálne reakcie: Nervový systém spracováva informácie získané zo senzorických orgánov a generuje vhodné reakcie na behaviorálne reakcie. Napríklad riadi kŕmenie, reprodukčné správanie, vyhýbanie sa predátorom a sociálne interakcie.
Integrácia a regulácia: Centrálny nervový systém integruje senzorické vstupy, spracováva informácie a odosiela výstup motora do rôznych častí tela. Reguluje fyziologické procesy, ako je srdcový rytmus, dýchanie, trávenie a reprodukcia.
Neurogenéza a učenie: Morské kone majú pozoruhodnú schopnosť regenerovať určité časti svojho nervového systému vrátane čuchovej žiarovky. Táto kapacita uľahčuje učenie a prispôsobenie sa meniacim sa podmienkam prostredia.