V ženskom reprodukčnom systéme sú vaječníky zodpovedné za výrobu a uvoľňovanie vajíčok. Tento proces je regulovaný rôznymi hormónmi, predovšetkým estrogénom a progesterónom. Tieto hormóny vyrábajú samotné vaječníky a hypofýza v mozgu a spolupracujú na kontrole menštruačného cyklu.
Estrogén hrá rozhodujúcu úlohu v počiatočných štádiách menštruačného cyklu. Keď sa hladiny estrogénu zvyšujú, stimulujú rast a vývoj folikulov v vaječníkoch. Každý folikul obsahuje nezrelé vajíčko. Keď hladiny estrogénu dosiahnu vrchol, spúšťa uvoľňovanie luteinizujúceho hormónu (LH) z hypofýzy. LH spôsobuje ovuláciu a uvoľňuje zrelé vajíčko z vaječníkov.
Progesterón sa na druhej strane stáva dominantným v druhej polovici menštruačného cyklu. Pomáha pri príprave maternice na možnú implantáciu oplodneného vajíčka. Ak k oplodneniu nedôjde, hladiny progesterónu sa znižujú, čo vedie k vylučovaniu výstelky z maternice počas menštruácie.
Súhra estrogénu a progesterónu zaisťuje presné načasovanie a koordináciu ovulácie a ďalšie udalosti v menštruačnom cykle. Hormonálne nerovnováhy alebo narušenia môžu ovplyvniť ovuláciu a prispieť k nepravidelným menštruačným cyklom alebo problémom s plodnosťou.