Jaguáre čelia niekoľkým hrozbám pre ich prežitie, vrátane straty biotopu, fragmentácie a lovu. Keď sa ich prirodzené biotopy premenia na poľnohospodársku pôdu a iný človekom vytvorený vývoj, jaguáre strácajú svoje úkryty, zdroje potravy a hniezdiská. To môže viesť k poklesu veľkosti populácie a reprodukčného úspechu.
Okrem toho sú jaguáre často lovené pre ich kožušinu, kožu a iné časti tela, ktoré sa používajú v tradičnej medicíne a predávajú sa ako trofeje. Výsledkom takéhoto lovu môže byť smrť jednotlivých jaguárov, zníženie celkovej populácie a narušenie dynamiky ekosystému.
Na riešenie týchto hrozieb a ochranu jaguárov sa úsilie o ochranu zameriava na implementáciu opatrení na ochranu biotopov, boj proti nezákonnému lovu a zvyšovanie povedomia o dôležitosti ochrany jaguárov. Zriadenie chránených oblastí, koridorov a podpora trvalo udržateľných postupov obhospodarovania pôdy môže pomôcť zachovať a obnoviť biotopy jaguárov. Vzdelávanie a udržateľné postupy v rámci miestnych komunít sú tiež nevyhnutné na podporu koexistencie medzi jaguármi a ľuďmi, znižovanie konfliktov a zabezpečenie ich dlhodobého prežitia.
Pokračovaním v tomto úsilí o ochranu je nádej zabezpečiť zdravú a udržateľnú budúcnosť pre jaguáre a zachovať ich ekologickú úlohu ako vrcholových predátorov v ekosystémoch, ktoré obývajú.