Z žalúdka sa Chyme presúva do tenkého čreva, ktorý je najdlhšou a najkomplexnejšou časťou tráviaceho systému. Tu prebieha väčšina absorpcie živín, ktorá sa uskutočňuje ako Chyme zmiešaná s tráviacimi enzýmami produkovanými pankreasom, ako je amyláza, lipáza a proteáza a žlč produkovaná pečeňou. Tieto enzýmy rozdeľujú komplexné uhľohydráty, tuky a bielkoviny na jednoduché cukry, mastné kyseliny a aminokyseliny. Steny tenkého čreva obsahujú malé, prstové projekcie nazývané klky, ktoré zvyšujú povrchovú plochu pre absorpciu živín.
Nesigovaný materiál zostal po absorpcii živín, ktorý sa presúva do hrubého čreva, ktorý pozostáva z hrubého čreva a konečníka. Colon absorbuje vodu a elektrolyty a zostávajúcu šialenstvo premieňa na tuhý odpad. Rektum ukladá tuhý odpad, až kým sa nedá vylúčiť z tela cez konečník počas procesu defekácie.