Golden Marmoset je obmedzený na malý geografický rozsah v brazílskom štáte Rio de Janeiro medzi riekami Itabapoana a Paraíba do Sul. Jeho prirodzeným prostredím je Atlantický pobrežný dažďový prales („Mata Atlântica“), ktorý od príchodu prvých európskych osadníkov prechádza ťažkým odlesňovaním. Odhaduje sa, že takmer 90% pôvodného pobrežného lesa v štáte Rio de Janeiro bolo stratených. Zostávajúce fragmenty sú často malé a izolované, vďaka čomu sú náchylnejšie na účinky fragmentácie biotopu. Strata biotopu a fragmentácia vedú k poklesu populácií zlatých marmosetov znížením dostupnosti potravín, zvýšením náchylnosti na predátorstvo a choroby a obmedzením toku rozptylu a génov medzi skupinami.
Lov a nelegálny obchod
Zlatý marmoset je cenený ako domáce zviera kvôli svojej malej veľkosti, krásnej sfarbení a poslušnej povahe. Tento druh bol zameraný na pytliaci pre obchod s domácimi zvieratami, ešte predtým, ako bol uvedený ako ohrozený. Nelegálny obchod so zlatými marmosetmi predstavuje významnú hrozbu pre tento druh, pretože môže viesť k vyčerpaniu divokých populácií a sťažuje ochrancom pracovníkov sledovať a monitorovať ich počet.
Zmena podnebia
Očakáva sa tiež, že zmena podnebia negatívne ovplyvní zlatý marmoset. Súčasný rozsah druhov by sa mohol stať nevhodným v dôsledku zmien teploty a zrážok a dostupnosť potravinových zdrojov sa môže znížiť. Fragmentácia biotopu by mohla ďalej zhoršiť účinky zmeny klímy znížením schopnosti druhu prispôsobiť sa a presunúť sa do vhodnejších oblastí.
Kombinácia týchto hrozieb viedla k klasifikácii Golden Marmoset, ako kriticky ohrozuje IUCN. Vyvíja sa úsilie o ochranu na ochranu zostávajúcich populácií tohto druhu vrátane vytvorenia chránených oblastí, obnovy biotopov a opatrení na zníženie poľovníctva a nezákonného obchodu.