1. konvergentný vývoj :Konvergentný vývoj sa vyskytuje, keď nesúvisiace druhy vyvíjajú podobné znaky nezávisle, často v reakcii na podobné environmentálne tlaky. Napríklad efektívny tvar tela delfínov a rýb sa v oboch skupinách vyvíjal nezávisle ako adaptácia pre efektívny pohyb vo vode. Napriek ich podobnému vzhľadu sú delfíny cicavce, zatiaľ čo ryby sú stavovce a patria do rôznych vývojových línií.
2. Zdieľané predkové vlastnosti :Niektoré druhy môžu zdieľať určité vlastnosti v dôsledku spoločného pôvodu, aj keď majú následne odlišné a získané odlišné vlastnosti. Napríklad netopiere a vtáky majú krídla, ale netopiere sú cicavce, zatiaľ čo vtáky sú plazy. Prítomnosť krídel v oboch skupinách naznačuje spoločnú evolučnú históriu.
3. Molekulárny dôkaz :Genetická analýza, ako napríklad sekvenovanie DNA, môže odhaliť skutočné evolučné vzťahy medzi druhmi. Porovnaním sekvencií DNA môžu vedci určiť stupeň genetickej podobnosti medzi rôznymi druhmi a odvodiť ich vývojové vzťahy. Dôkaz DNA môže odhaliť úzke genetické vzťahy aj medzi druhmi, ktoré sa javia veľmi odlišné morfologicky.
4. adaptívne žiarenie :Adaptívne žiarenie sa vyskytuje, keď jeden druh predkov vedie k rade rôznych druhov s odlišnými morfológiami a úpravami. Príkladom je Darwinove pätky na Galapágových ostrovoch, kde rôzne druhy Finch sa vyvinuli rôzne tvary zobáka, aby využili konkrétne zdroje potravín. Napriek svojim variáciám v zobákovej štruktúre tieto pätky zdieľajú spoločného predka a úzko súvisia.
Preto je možné, že dva druhy, ktoré vyzerajú veľmi odlišne od seba, sú viac príbuzné ako podobné iným druhom v dôsledku faktorov, ako je konvergentný vývoj, zdieľané pôvodné znaky, molekulárne dôkazy a adaptívne žiarenie.