1. Kostra: Kostné ryby majú kostru vyrobenú z kosti, zatiaľ čo chrupavky majú kostru vyrobenú z chrupavky. Chrupavka je flexibilné, ne-mineralizované spojivové tkanivo, zatiaľ čo kosť je tvrdé mineralizované tkanivo.
2. Scales: Kostné ryby majú váhy, ktoré sú vyrobené z kosti alebo modifikovanej kosti, zatiaľ čo chrupavkové ryby majú váhy, ktoré sú vyrobené z materiálu nazývaného plakoid. Plakoidné stupnice sú malé, zubné štruktúry, ktoré sú zabudované do kože.
3. Plutvy: Kostné ryby majú plutvy, ktoré sú podporované kostnými lúčmi, zatiaľ čo chrupavkové ryby majú plutvy, ktoré sú podporované chrupavkami.
4. Žiabre: Kostné ryby majú žiabre, ktoré sú pokryté kostným operáciou, zatiaľ čo chrupavkové ryby majú žiabre, ktoré nie sú pokryté operáciou.
5. Zuby: Kostné ryby majú zuby, ktoré sa nachádzajú v čeľustí, zatiaľ čo chrupavky majú zuby, ktoré sa nachádzajú na čeľusti a žiabrových oblúkach.
6. Oči: Kostné ryby majú oči, ktoré sa nachádzajú na bokoch hlavy, zatiaľ čo chrupavky majú oči, ktoré sa nachádzajú na vrchu hlavy.
7. Dierka: Kostné ryby majú dve nosné dierky, zatiaľ čo chrupavky majú jednu nosovú dierku.
8. Špirály: Kostné ryby nemajú špirály, zatiaľ čo chrupavkové ryby majú špirály, ktoré sú malé otvory na vrchu hlavy, ktoré umožňujú prúdiť vodu do ich žiabrov.
9. Caudálna plutva (Tailfin): Kostné ryby majú kaudálnu plutvu, ktorá je symetrická, čo znamená, že na oboch stranách má rovnaký tvar, zatiaľ čo chrupavka má kaudálnu plutvu, ktorá je asymetrická, čo znamená, že ide o rôzne tvary na oboch stranách.