* urbanizácia a rozvoj: Rozšírenie miest a miest často vedie k strate prírodných biotopov, pretože sa premieňajú na obytné oblasti, komerčné zóny alebo priemyselné miesta.
* odlesňovanie: Vyčistenie lesov pre poľnohospodárstvo, drevo alebo iné účely môže viesť k strate biotopu mnohých rastlinných a živočíšnych druhov.
* Ťažba a lomka: Ťažobné operácie a extrakcia minerálov často vyžadujú odstránenie veľkých oblastí prírodného biotopu.
* Znečistenie: Znečistenie priemyselných odvetví, poľnohospodárstva a iných zdrojov môže kontaminovať a degradovať biotopy, vďaka čomu sú pre mnohé druhy nevhodné.
* Zmena podnebia: Zmena podnebia môže viesť k zmenám teploty, zrážok a hladiny mora, ktoré môžu zmeniť biotopy a urobiť z nich menej vhodné pre určité druhy.
Strata biotopu je hlavnou hrozbou pre biodiverzitu a prispela k vyhynutiu mnohých druhov na celom svete. Je dôležité rozpoznať a riešiť príčiny straty biotopu a implementáciu ochrany opatrení na ochranu a obnovenie prírodných biotopov na zmiernenie tejto hrozby.