1. Strata biotopu: Jaguári obývajú rôzne ekosystémy, ako sú dažďové pralesy, močiare a trávne porasty. Bohužiaľ, tieto biotopy sa často vyčistia pre poľnohospodárstvo, ťažbu dreva, ťažbu a rozvoj miest. Táto strata a fragmentácia ich prírodných biotopov výrazne ovplyvňujú populácie Jaguar.
2. Lov a pytliactvo: Jaguári sú lovení a pošírovaní za svoju krásnu kožušinu, ktorá je vysoko cenená v nelegálnom obchode s voľne žijúcimi živočíchmi. Okrem toho sú niekedy zabití pri odvetných opatreniach za vnímané hrozby pre hospodárske zvieratá. Tieto nezákonné činnosti významne prispievajú k poklesu obyvateľstva Jaguar.
3. Obchodovanie s voľne žijúcimi zvieratami: Jaguári sú zajatí z divočiny a nezákonne sa obchodujú na rôzne účely, vrátane exotických domácich miláčikov, na použitie v tradičnej medicíne alebo na predaj zoologických záhrad a divočiny. Obchodovanie s voľne žijúcimi živočíchmi narúša dynamiku prírodnej populácie a ďalších ohrozujúcich Jaguars.
4. Konflikt ľudského jaguaru: Jaguári niekedy korisťujú hospodárske zvieratá, čo vedie ku konfliktom s ľuďmi, ktorí závisia od týchto zvierat pre výživu. V reakcii na to môžu byť Jaguars úmyselne usmrtené alebo ich biotopy sú úmyselne zmenené, čo negatívne ovplyvňuje ich prežitie.
5. Obmedzená genetická diverzita: Jaguári historicky trpeli genetickými prekážkami, čo viedlo k zníženej genetickej diverzite. Vďaka tomu je tento druh náchylnejší na choroby, znižuje ich schopnosť prispôsobiť sa meniacemu sa prostredia a zvyšuje riziko vyhynutia.
6. Vyčerpanie koristi: Jaguars sa spoliehajú na rôzne druhy koristi na jedlo. Avšak preventovanie týchto zvierat koristi ľuďmi na mäso a iné účely znížilo dostupnosť potravín pre jaguáre, čo ovplyvnilo ich prežitie a reprodukčný úspech.
Ohrozenie Jaguarov zdôrazňuje naliehavú potrebu úsilia o ochranu, ako je ochrana biotopov, anti-pytliace opatrenia a verejné vzdelávanie, s cieľom zabezpečiť dlhodobé prežitie týchto veľkolepých makrofónov a zachovanie ekologickej integrity ich biotopov.