1. Pytliactvo: Jednou z najväčších hrozieb pre kozorožca sibírskeho je pytliactvo. Tieto zvieratá sú cenené pre svoje rohy, mäso a kožu, čo ich robí zraniteľnými voči nelegálnemu lovu. Napriek úsiliu o ochranu a opatreniam proti pytliactvu pytliactvo naďalej predstavuje značnú výzvu.
2. Strata biotopov: Prežitie sibírskych kozorožcov závisí od špecifických horských biotopov. Ľudské činnosti, ako je rozvoj infraštruktúry, ťažba, ťažba dreva a nadmerné spásanie hospodárskymi zvieratami, prispeli k strate a degradácii ich prirodzených biotopov. V dôsledku toho sú sibírske kozorožce nútené súťažiť s inými druhmi o potravu a zdroje a ich populácia klesá.
3. Zmena klímy: Klimatické zmeny sa tiež ukázali ako hrozba pre kozorožca sibírskeho. Vyššie teploty a zmeny v zrážkových vzorcoch môžu ovplyvniť vegetáciu a rastlinné spoločenstvá kritické pre ich prežitie. Zmeny vo vegetácii ovplyvňujú dostupné krmivo pre kozorožca sibírskeho, čo ovplyvňuje ich výživu a celkovú pohodu.
4. Choroby: Kozorožce sibírske sú náchylné na rôzne choroby, ktoré sa môžu rýchlo šíriť cez ich populácie. Niektoré z týchto chorôb môžu byť zavlečené prostredníctvom domáceho dobytka alebo prenášané hmyzom a parazitmi. Choroby môžu zdevastovať populácie kozorožcov, čo vedie k vysokej úmrtnosti, čo ďalej znižuje ich celkový počet.
5. Obmedzená genetická diverzita: Kvôli ich relatívne malým a izolovaným populáciám má kozorožec sibírsky obmedzenú genetickú diverzitu. To ich robí náchylnejšími na negatívne účinky príbuzenského kríženia a zmien prostredia. Obmedzená genetická diverzita znižuje ich odolnosť a prispôsobivosť rôznym výzvam, čím bráni ich schopnosti odolávať vonkajším tlakom.
V dôsledku týchto kombinovaných faktorov má kozorožec sibírsky v súčasnosti štatút ohrozeného druhu. Ochranárske organizácie, vlády a miestne komunity implementujú rôzne opatrenia na ochranu týchto zvierat a zachovanie ich prirodzených biotopov, ale úspech ich úsilia o ochranu zostáva náročný vzhľadom na závažnosť hrozieb, ktorým čelia.