Väčšie predátory:
* vlci: Vlci sú primárnym dravcom kojotov, najmä v oblastiach, kde sa oba druhy prekrývajú.
* medvede: Aj keď sú medvede menej bežné, najmä medvede, môžu korisťovať kojoty, najmä ak vychytávajú alebo lovia.
* horské levy: Horské levy, najmä v západných Spojených štátoch, sú schopné zabíjať kojoty, hoci je pravdepodobnejšie, že pôjdu po väčšej koristi.
Ostatné predátory:
* bobcats: Bobcats, menšie ako kojoty, niekedy môžu korisťovať mladé kojoty alebo kojoty, ktoré sú oslabené alebo zranené.
* Veľkí dravci: Golden Eagles a ďalší veľkí dravci môžu zobrať mladé alebo menšie kojoty.
* Ostatné kojoty: Samotné kojoty sa môžu zapojiť do kanibalizmu, najmä počas drsných zimy alebo keď sú zdroje nedostatočné.
Ľudia:
* Lov: Kojoty často lovia ľudia za kontrolu populácie a ochranu hospodárskych zvierat.
Ďalšie hrozby:
* choroby: Kojoty môžu podľahnúť rôznym chorobám vrátane besnoty, distemper a parazitov.
* Vozidlá: Kojoty sú často zasiahnuté vozidlami, najmä v blízkosti ciest a diaľnic.
Je dôležité poznamenať, že predácia Coyote nie je častá, pretože sú to veľmi prispôsobivé a vynaliezavé zvieratá. Títo predátori však zohrávajú úlohu pri regulácii populácií kojotov.