Invazívne druhy, ako napríklad ázijský kapr v Severnej Amerike alebo ropucha trstiny v Austrálii, môžu narušiť potravinové reťazce konkurenciou s natívnymi druhmi o zdroje a zmenou dynamiky predátorov. Nové patogény a choroby môžu významne ovplyvniť konkrétne druhy v potravinovom reťazci a mať kaskádové účinky na celý ekosystém. Posuny rozsahu vyvolané podnebím alebo fenologické zmeny môžu viesť k novým interakciám medzi druhmi, ktoré menia svoje úlohy alebo pozície v potravinovom reťazci.
Zavedenie nových druhov, vznik chorôb, zmeny založené na zmene klímy a trofické kaskády predstavujú významné faktory, ktoré môžu zmeniť a pretvoriť potravinové reťazce v rôznych ekosystémoch. Pochopenie tejto dynamiky je rozhodujúce pri zachovaní ekologickej rovnováhy a udržiavaní rozmanitosti a odolnosti prírodných potravinových sietí.