- nízka genetická diverzita: Účinok zakladateľa môže viesť k populácii s nižšou genetickou diverzitou ako materská populácia, pretože iba malá podskupina jednotlivcov je zapojená do založenia novej populácie. To vedie k vyššej úrovni inbreedingu a zníženej genetickej variácie, ktorá môže poškodiť schopnosť populácie prispôsobiť sa jej prostrediu.
- Zvýšené riziko vyhynutia: Malá zakladajúca populácia je náchylnejšia na vyhynutie ako masívna populácia v dôsledku niekoľkých faktorov, vrátane zvýšeného inbreedingu, zníženej genetickej variácie a obmedzenej ponuky zdrojov. Inbreeding môže viesť k expresii škodlivých vlastností v dôsledku párovania podobného genetického materiálu.
- evolučná divergencia: Účinok zakladateľa môže iniciovať proces evolučnej divergencie medzi založenou populáciou a materskou populáciou. V priebehu času môže založená populácia zažiť rôzne výberové tlaky a nezávisle sa prispôsobiť, čo vedie k variáciám genetických znakov a potenciálnym udalostiam špekulácie.
- Rýchla adaptácia: Za určitých okolností môže zakladateľský efekt viesť k rýchlej adaptácii. Ak malá populácia zažije nové a iné prostredie, môžu existovať silné výberové tlaky pre určité vlastnosti, ktoré pomáhajú jednotlivcom prežiť v nových podmienkach. To môže mať za následok rýchle zmeny vo frekvenciách alel a vývoj nových vlastností.
- Genetické poruchy: Účinok zakladateľa môže mať za následok vyšší výskyt konkrétnych genetických porúch v rámci populácie v dôsledku zvýšenej pravdepodobnosti, že jednotlivci nesú rovnaké škodlivé alely. Ak sú v zakladajúcej populácii prítomné škodlivé alely, je pravdepodobnejšie, že sa rozšíria a ovplyvňujú podstatnú časť populácie.