Pesticídy :Pesticídy používané na kontrolu hlodavcov a iných škodcov môžu tiež otráviť prérie psov.
choroby :Prairie Dogs sú náchylné na rôzne choroby, vrátane sylvatického moru, tularémie a psieho distemperu. Tieto choroby sa môžu šíriť medzi kolóniami prérie psov a spôsobiť pokles populácie.
lov :V niektorých oblastiach sú prérijskí psi lovení na šport alebo na ochranu hospodárskych zvierat.
predácia :Prairie Dogs sú korisťovaní rôznymi predátormi vrátane kojotov, vlkov, líšky a dravých vtákov.
Vďaka týmto faktorom je niekoľko druhov prérie psov uvedených ako ohrozené alebo ohrozené podľa zákona o ohrozených druhoch. Prebieha úsilie o ochranu na ochranu svojich biotopov a riadenie hrozieb pre ich populáciu.