1. Genetický pôvod:
Klonované zviera je geneticky identické s darcovskou bunkou poskytujúcou jej jadro. To znamená, že klonované zviera nesie presne tie isté genetické informácie ako pôvodný darca. Na rozdiel od toho, pohlavne produkované zvieratá dedia genetický materiál od oboch rodičov prostredníctvom splynutia gamét (vajíčka a spermie), čo vedie ku genetickej diverzite a zmiešaniu znakov.
2. Mitochondriálna DNA (mtDNA):
Počas SCNT sa zvyčajne používa cytoplazma vajíčka príjemcu vrátane jeho mitochondrií. Výsledkom je, že klonované zviera má mitochondriálnu DNA darcu vajíčka a nie darcu jadra somatických buniek. V niektorých prípadoch však boli vyvinuté metódy na zachovanie mitochondriálnej DNA somatickej bunky, čo znamená, že klonované zviera môže mať mtDNA od darcu vajíčka aj od darcu jadra somatickej bunky. Sexuálne rozmnožované zvieratá naopak dedia mtDNA výlučne od matky, keďže sa nachádza iba vo vajíčku.
3. Epigenetické modifikácie:
Epigenetické modifikácie sú chemické zmeny v DNA, ktoré ovplyvňujú génovú expresiu bez zmeny samotnej sekvencie DNA. SCNT môže viesť k zmenám v epigenetických vzorcoch, keď je jadro somatických buniek preprogramované tak, aby sa správalo ako embryonálne jadro. To môže mať za následok rozdiely v génovej expresii a potenciálne aj fenotypové variácie medzi klonovanými zvieratami a ich genetickými náprotivkami produkovanými sexuálnou reprodukciou. Epigenetické modifikácie môžu byť ovplyvnené aj faktormi, ako je vek a typ bunky darcu, ako aj prostredie vajíčka príjemcu.
4. Vývinové abnormality:
V niektorých prípadoch môžu klonované zvieratá zaznamenať vývojové abnormality alebo zdravotné problémy v dôsledku problémov s preprogramovaním alebo prerušením počas procesu klonovania. Tieto abnormality môžu siahať od menších fyzických defektov až po veľké zdravotné komplikácie, vrátane zvýšenej náchylnosti na niektoré choroby alebo zníženej plodnosti.
Je dôležité poznamenať, že technológie a techniky používané pri klonovaní neustále napredujú a výskumníci pokračujú v optimalizácii procesu, aby tieto rozdiely minimalizovali a zabezpečili pohodu a zdravie klonovaných zvierat.