Prírodné predátory:
* Väčšie kandidy: Vlci, najmä v oblastiach, kde sa prekrývajú, môžu korisťovať kojoty, najmä mladých alebo slabých jedincov.
* medvede: Aj keď to nie je priamy predátor, medvede môžu konkurovať kojotom o jedlo a občas ich zabiť.
* horské levy: V oblastiach, v ktorých sa ich rozsahy prekrývajú, môžu horské levy korisťovať kojoty, najmä mladých alebo osamelých jedincov.
* bobcats: Bobcats sú menšie ako kojoty, ale môžu s nimi súťažiť o jedlo a niekedy korisť mladých kojotov.
* Veľké dravé vtáky: Zlaté orly a sovy s veľkým rohom môžu občas korisťovať kojoty, najmä mladé.
Hrozby vyrábané na človeku:
* poľovníctvo a zachytenie: Coyotes sa lovia a uväzňujú v mnohých oblastiach, najmä v prípade kontroly populácie alebo na ochranu hospodárskych zvierat.
* Zrážky vozidla: Kojoty často zabíjajú autá, najmä v mestských a prímestských oblastiach.
* choroba: Kojoty sú náchylné na choroby ako besnota, distemper a mange, ktoré môžu ovplyvniť ich prežitie.
* Strata biotopu: Keď ľudia naďalej rozvíjajú pôdu, kojotové biotopy sa roztriešte a zničujú, čo im sťažuje prosperovanie.
Konkurencia o jedlo:
* Ostatné predátory: Kojoty súťažia s inými predátormi, ako sú líšky, bobcaty a dokonca aj domáce psy, o potravinové zdroje.
* ľudia: Ľudia môžu byť tiež zdrojom konkurencie o kojoty, najmä v oblastiach, kde sa kojoti prispôsobili na vychytávanie od ľudského odpadu.
Celkovo, zatiaľ čo kojoty sú vysoko prispôsobivými a úspešnými predátormi, čelia mnohým hrozbám z prírodných aj ľudských zdrojov.