2. Strata biotopu a degradácia :Región Perzského zálivu zažil rozsiahly rozvoj pobrežia a stratu biotopov, čo vedie k zničeniu a fragmentácii prírodných biotopov, od ktorých zvieratá závisia od prežitia. Mokrade, základné rozmnožovanie a kŕmenie pre mnohé druhy, sa stratili pri alarmujúcom rýchlosti. Ovplyvnili sa aj mangrovy a postele morských rias, čo znižuje dostupnosť kritických biotopov a ovplyvňuje rovnováhu ekosystému.
3. Znečistenie :Pretrvávajúce znečistenie z rôznych zdrojov vrátane priemyselného prepustenia, poľnohospodárskeho odtoku a vypúšťania odpadových vôd prispelo k zhoršeniu kvality vody v Perzskom zálive. Chemikálie a toxíny môžu poškodiť morský život ohrozením ich zdravia, rastu a reprodukčného úspechu. Znečistenie môže tiež vstúpiť do potravinového reťazca, bioakkumulovanie a zväčšovanie prostredníctvom následných trofických hladín.
4. Nadmerné ryby :Neudržateľné rybárske postupy, ako napríklad nadmerné rybolovky a vedľajšie vedľajšie diela, výrazne znížili veľkosť populácie mnohých morských druhov v Perzskom zálive. Nadmerovanie vyčerpáva dostupnosť druhov koristi pre predátorov, vytvára nerovnováhu v ekosystéme a ovplyvňuje celý potravinový web. Vedľajší záväzok, nezamýšľané zachytenie necieľových druhov, tiež vedie k strate mnohých morských zvierat vrátane delfínov a morských korytnačiek.
5. Choroba :Mexický záliv je domovom rôznych chorôb a škodlivých kvetov rias (Habs). Vírusové a bakteriálne choroby, ako je morbillivírus u delfínov, môžu medzi morskými cicavcami spôsobiť ohniská a vysokú úmrtnosť. HAB, spôsobené nadmerným rastom určitých druhov rias, môžu produkovať toxíny, ktoré môžu choď a zabíjať ryby a iný morský život.
6. Zmena podnebia :Mexický záliv prežíva vplyvy zmeny podnebia vrátane rastúceho teploty mora, okyslení oceánov a zmien v poveternostných vzorcoch. Tepšie teploty môžu zdôrazniť morský život a zmeniť kritické procesy, ako je reprodukcia a rast. Acidifikácia oceánu môže negatívne ovplyvniť druhy, ktoré vytvárajú škrupiny a štruktúry uhličitanu vápenatého. Zmeny v poveternostných vzorcoch môžu tiež narušiť migračné vzorce, dostupnosť potravín a celkovú rovnováhu ekosystému.