- Strata a degradácia biotopu: Africké tučniaky sa spoliehajú na pobrežné biotopy chovu, hniezdenia a kŕmenia, ale tieto biotopy sú ohrozené ľudskými činnosťami, ako je pobrežný rozvoj, znečistenie a nadmerné ryby. Najmä pobrežný vývoj viedol k zničeniu alebo fragmentácii hniezdnych miest.
- nadmerné rybolov: Africké tučniaky sú tiež ohrozené nadmerným rybolovom, pretože sa spoliehajú na ryby na svoju stravu. Nadmerné ryby môže znížiť dostupnosť potravín pre africké tučniaky a sťažiť prežitie. Niektoré druhy rýb, na ktoré sa africké tučniaky spoliehajú, sú prehnané na spotrebu a rekreačné účely.
- Zmena podnebia: Zmena podnebia je ďalšou hlavnou hrozbou pre africké tučniaky. Stúpajúce hladiny mora a zmeny v teplotách oceánov môžu narušiť šľachtiteľský cyklus tučniakov, znížiť zásobovanie potravinami a viesť k zničeniu ich hniezdnych miest.
- Znečistenie: Znečistenie z rôznych zdrojov vrátane ropných škvŕn, plastového odpadu a výboja odpadových vôd môže mať tiež negatívny vplyv na africké tučniaky. Olejové úniky dokážu nalepiť svoje perie, takže ich nedokážu regulovať svoju telesnú teplotu a vodotesné telá, čo vedie k smrti. Plastový odpad je možné požívať tučniakmi a spôsobiť blokády v ich tráviacich traktoch a výtok odpadových vôd môže kontaminovať ich potravinové zdroje.
- predácia: Africké tučniaky čelia hrozbám predátorov, a to na pevnine aj na mori. Na súši ich môžu napadnúť mongózy a mačky, zatiaľ čo na mori ich môžu korisťovať žraloky a ďalší veľkí morský dravci.
Všetky tieto faktory prispeli k úpadku populácií afrických tučniakov, čo viedlo k ich klasifikácii, ako ohrozuje Medzinárodná únia na ochranu prírody (IUCN). Prebieha úsilie o ochranu na riešenie týchto hrozieb a chrániť zvyšné populácie afrických tučniakov.