1. Strata biotopu: Rozvoj pobrežných oblastí, urbanizácia a rozširovanie ľudských aktivít sa rýchlo znížilo a fragmentovali prírodné biotopy tuleňov stredomorského mnícha. Tieto tesnenia vyžadujú nerušené pobrežné oblasti s jaskyňami a skalnatými pobrežiami na rozmnožovanie a odpočinok, ktoré boli vážne ovplyvnené ľudskými činnosťami.
2. lov a priame zabíjanie: Stredomorské pečate mníchov boli historicky lovené za svoju kožušinu, blubber a mäso, čo vedie k vážnemu poklesu populácie. Aj keď je poľovníctvo vo väčšine krajín nezákonné, stále sa vyskytujú nezákonné vraždy, najmä v odľahlých oblastiach.
3. vedľajšie: Náhodné zachytenie v rybárskom výstroji, známe ako vedľajšie riadky, predstavuje významnú hrozbu pre stredomorské pečate mníchov. Tieto tesnenia sa môžu zapletať do rybárskych sietí, pascí a línií, čo vedie k zraneniu alebo smrti. Vedľajšie vedľajšie prvky sú obzvlášť bežné v oblastiach s neregulovaným alebo slabo riadeným rybolovom.
4. Znečistenie: Stredozemné more je silne znečistené v dôsledku priemyselného odpadu, vypúšťania odpadových vôd a únikov ropy. Znečisťujúce látky, ako sú ťažké kovy, chemikálie a plasty, môžu poškodiť stredomorské tesnenia mníchov priamo tým, že spôsobujú zdravotné problémy alebo nepriamo ovplyvňovaním ich biotopu a koristi.
5. Zmena podnebia: Meniace sa podnebie tiež prispieva k poklesu stredomorských pečatí mníchov. Stúpajúce hladiny mora a meniace sa poveternostné vzorce ovplyvňujú biotopy tesnení, zatiaľ čo zvyšovanie teploty vody môže narušiť ich šľachtiteľské cykly a ovplyvniť ich druhy koristi.
6. Nedostatok genetickej diverzity: Populácia stredomorských mníchových tuleňov je malá a fragmentovaná, čo vedie k nedostatku genetickej diverzity. Vďaka tomu je tento druh menej odolný voči zmenám v životnom prostredí, chorobami a inými hrozbami, čím sa zvyšuje ich zraniteľnosť voči vyhynutiu.
Vyvíja sa úsilie na ochranu stredomorských pečatí mních prostredníctvom opatrení na ochranu ochrany, ako je zriadenie morských chránených oblastí, nariadenia o rybárskych praktikách a kampaní na zvýšenie povedomia verejnosti. Získanie populácie tuleňov Stredozemného mnícha, ktoré prispievajú k ich ohrozeniu, je však kvôli rôznym faktorom, ktoré prispievajú k ich ohrozeniu, významnou výzvou.