Nemeckí pastieri, rovnako ako všetci ostatní psi, sa reprodukujú sexuálne. Keď mužský nemecký pastier kamarátov so ženským nemeckým ovčiakom, muž uloží spermie do reprodukčného traktu ženy. Spermie potom prechádzajú do vaječníkov ženy, kde oplodňuje vajcia. Oplodné vajcia sa potom implantujú do maternice ženy, kde sa vyvíjajú na šteniatka. Obdobie tehotenstva pre nemeckých ovčiakov je približne 63 dní, po ktorom žena porodí vrh šteniat.