Tu je dôvod:
* Selektívne šľachtenie sa zameriava na konkrétne vlastnosti: Chovatelia vyberajú pre požadované vlastnosti, čo často vedie k zúženiu génovej skupiny. To znamená, že výsledné organizmy majú obmedzenejší rozsah génov a sú náchylnejšie na choroby alebo zmeny životného prostredia.
* Prírodné organizmy majú širšiu genetickú variáciu: Organizmy, ktoré sa prirodzene vyvinuli, majú oveľa širšiu škálu génov, čo umožňuje väčšiu adaptabilitu a odolnosť. Je menej pravdepodobné, že ich vymazajú choroby alebo náhlymi zmenami v životnom prostredí.
Z tohto dôvodu je udržiavanie genetickej diverzity tak zásadné v úsilí o ochranu. Pomáha populáciám prispôsobiť sa a prežiť z dlhodobého hľadiska.