Asexuálna reprodukcia:Mnoho jednobunkových organizmov sa reprodukuje asexuálne, čo znamená, že produkujú potomkovia geneticky identických sami. V takýchto prípadoch sa koncept interbreedingu a výmena genetického materiálu medzi rôznymi jednotlivcami stáva irelevantná.
Nedostatok jasných hraníc:Jednobunkové organizmy často existujú ako populácie, kde jednotlivci môžu vymieňať genetický materiál prostredníctvom rôznych mechanizmov, ako je konjugácia, transformácia alebo transdukcia. Tieto procesy sa môžu vyskytnúť medzi geneticky rozmanitými jedincami, čo sťažuje vymedzenie rôznych hraníc druhov založených výlučne na internáte.
Horizontálny prenos génov:Horizontálny prenos génov je bežným javom medzi jednobunkovými organizmami, kde gény sa môžu prenášať medzi vzdialenými druhmi. To môže mať za následok získanie nových vlastností a genetickej diverzity, čím sa ďalej komplikuje definíciu druhov na základe interbreedingu.
Rýchly vývoj:Jednobunkové organizmy majú často krátke výroby časov a vysokú mieru mutácií, čo vedie k rýchlemu vývoju. To znamená, že populácie sa môžu geneticky rýchlo líšiť, čím sa internátor medzi vzdialene príbuznými jedincami v priebehu času menej pravdepodobne.
Koncept druhov je okrem toho ľudský konštrukt používaný na kategorizáciu a porozumenie rozmanitosti života. Zatiaľ čo interbreeding je užitočným kritériom na definovanie druhov v mnohých prípadoch, jeho aplikácia na jednobunkové organizmy môže byť problematická z dôvodu ich jedinečných charakteristík a reprodukčných stratégií. Namiesto toho sa vedci často spoliehajú na kombináciu genetických, fenotypových a ekologických údajov na vymedzenie hraníc druhov medzi jednobunkovými organizmami.