Chromozóm Y obsahuje gén nazývaný gén SRY, ktorý kóduje proteín, ktorý je nevyhnutný pre vývoj mužov. Gén SRY sa nachádza na krátkom ramene chromozómu Y a je prítomný u všetkých mužov, ale nie u žien.
Keď je zapnutý gén SRY, spúšťa kaskádu udalostí, ktoré vedú k rozvoju mužských reprodukčných orgánov. Tieto udalosti zahŕňajú tvorbu semenníkov, produkciu testosterónu a diferenciáciu vonkajších genitálií na mužské štruktúry.
V neprítomnosti génu Sry sa embryo vyvinie na samicu. Dôvodom je skutočnosť, že ženský reprodukčný systém je predvolenou vývojovou cestou embryí. U žien sa vaječníky vyvíjajú a produkujú estrogén a vonkajšie genitálie sa diferencujú na ženské štruktúry.