opelenie: Muchy hrajú základnú úlohu pri opeľovaní, čo je proces prenosu peľu z mužskej časti kvetu do ženskej časti, čo umožňuje oplodnenie a reprodukciu v kvitnúcich rastlinách. Mnoho druhov múch, ako sú hoverflies, kvetinové muchy a tachinidové muchy, navštevujú kvety, aby sa živili nektár a peľ. Pritom neúmyselne nesú peľové zrná medzi kvetmi, čo uľahčuje krížové opelenie. Tento proces je nevyhnutný pre reprodukciu a genetickú diverzitu mnohých druhov rastlín.
rozptyl semien: Niektoré druhy múch, najmä určité druhy ovocných múch, môžu rozptýliť semená rastlín. Tieto muchy sa živia ovocím a požívajú semená, ktoré prechádzajú ich tráviacim systémom bez poškodenia. Keď muchy ukladajú svoj odpad, rozptýlia semená na širšiu oblasť, čo prispieva k šíreniu a klíčeniu rastlín.
Biodiverzita: Muchy sú neoddeliteľnou súčasťou biodiverzity. Podávajú ako jedlo pre rôzne zvieratá, vrátane vtákov, pavúkov, plazov a obojživelníkov. Prítomnosť múch v ekosystéme si zachováva jemnú rovnováhu a zohráva úlohu pri udržiavaní potravinových sietí a ekologických interakcií.
Cyklistika výživy: Muchy prispievajú k cyklistike živín v ekosystéme. Ako rozkladače sa niektoré druhy múch živia mŕtvymi organickými látkami, ako je rozpad ovocia, zelenina a jatočné telá. Rozdelením týchto materiálov uvoľňujú základné živiny späť do životného prostredia, vďaka čomu sú k dispozícii pre iné organizmy, ktoré môžu využívať.
Biologická kontrola: Muchy sa niekedy používajú ako biologické kontrolné činidlá na riadenie populácií škodcov. Napríklad určité druhy múch sa môžu použiť na kontrolu konkrétnych škodcov hmyzu v poľnohospodárskom prostredí parazitizáciou alebo ležiacim na ne.
Lekársky a vedecký výskum: Muchy sa široko používajú v lekárskom a vedeckom výskume. Napríklad ovocná muška (Drosophila Melanogaster) je modelový organizmus v genetike a biológii, ktorý poskytuje pohľad na základné biologické procesy vrátane vývoja, dedičstva a správania.
Je však nevyhnutné poznamenať, že nie všetky muchy sú prospešné a niektoré môžu byť škodcami alebo vektormi chorôb. Na minimalizáciu negatívnych vplyvov múch sú potrebné správne postupy riadenia škodcov a zároveň uznávajú ich ekologický význam a potenciálne výhody.