Savannah sa nachádza v oblasti náchylnej na hurikány a mesto v minulosti zasiahlo niekoľko veľkých hurikánov. Posledným veľkým hurikánom, ktorý zasiahol Savannah, bol hurikán Matthew v roku 2016, ktorý spôsobil rozsiahle škody a záplavy.
Záplavy
Savannah je tiež ohrozená záplavami z rieky Savannah a Atlantického oceánu. Okrem hurikánov môžu výdatné zrážky spôsobiť v meste aj záplavy.
Náraz búrky
Príval búrok je nárast hladiny mora, ktorý je spôsobený hurikánom. Nával búrok môže spôsobiť značné škody pobrežným komunitám vrátane záplav, erózie a štrukturálnych škôd.
Tornáda
Savannah je tiež ohrozená tornádami, aj keď sú menej časté ako hurikány. Tornáda môžu spôsobiť značné škody na majetku a infraštruktúre.
Zemetrasenia
Savannah sa nachádza v seizmickej zóne a mesto v minulosti zažilo niekoľko zemetrasení. Posledným veľkým zemetrasením, ktoré postihlo Savannah, bolo zemetrasenie v Charlestone v roku 1886, ktoré v meste spôsobilo rozsiahle škody.