Vysoké teploty: Nadmerné teplo môže spôsobiť denaturáciu bielkovín a dehydratáciu vajíčka, čo vedie k úmrtnosti embryí. Presná prahová hodnota teploty, pri ktorej vajcia zomierajú, sa môže meniť medzi druhmi a špecifickými inkubačnými podmienkami, ale vo všeobecnosti sa predĺžená expozícia teplotám nad 39,5 stupňov Celzia (103 stupňov Fahrenheita) považuje za škodlivú pre väčšinu vtáčých vajíčok.
Nízke teploty: Aj keď krátke vystavenie mierne chladným teplotám nemusí byť smrteľné, predĺžené obdobia pod optimálnym teplotným rozsahom môžu spomaliť embryonálny vývoj a znížiť rýchlosť vyliahnutia. Všeobecne môžu teploty pod 37,5 stupňov Celzia (99,5 stupňov Fahrenheit) brániť rastu embryí, zatiaľ čo teploty pod 30 stupňov Celzia (86 stupňov Fahrenheita) môžu viesť k vývojovým abnormalitám.
Je dôležité udržiavať konzistentné teploty počas celého obdobia inkubácie, pričom sa vyhýbajú rýchlym výkyvom, ktoré môžu tiež zdôrazniť embryá. Správne monitorovanie a úprava inkubátorov sú rozhodujúce pre zabezpečenie optimálnych podmienok pre úspešné vyliahnutie vajíčok.